Для подтверждения нужно загрузить в корень сайта файл. Как это сделать?

Подтвердить права при помощи загрузки файла в корень сайта, увы, нельзя. Вы можете подтвердить права указав мета-тега.

Откройте страницу Яндекс.Вебмастер: https://webmaster.yandex.ru.

Нажмите «Добавить сайт».

Напишите адрес сайта и нажмите «Добавить».

Откроется страница проверки прав. Выберите метод проверки «Мета-тег» и скопируйте числовое значение тега.

Перейдите на Тильду. Настройки сайта → Еще → Подтверждение прав. Вставьте скопированное число в поле «Код подтверждения прав для Яндекса» Сохраните настройки и опубликуйте все страницы.

Подробная инструкция Как подтвердить право собственности на домен.